本发明公开了一种复杂电力电子变换器的工作模态分析方法，包括步骤：1)将变换器所含各元件画成树状图；2)将树状图中的元件分成不同等级；3)列出每级中所有开关元件可能存在的通断状态组合；4)每级中的开关通断状态组合分别与非开关元件叠加；5)不同等级元件之间叠加，每叠加一级即获得新的模态；6)对模态进行筛选，剔除无效模态；7)依据电流实际流通情况合并有效模态，得出变换器有效工作模态的种类。本发明可获得电力电子变换器的所有工作模态，针对模态的识别全面且简单，可用于包含多开关电力电子变换器电路模态的分析。