本发明公开了一种光伏逆变器系统电压跟踪和谐波抑制的方法及系统，该方法包括下述步骤：以光伏并网逆变器输出电压和参考的输出电压之间的误差为控制量，建立光伏并网逆变器线性时不变系统模型；采用内模原理构建控制器的增强系统；采用李雅普诺夫稳定性判别方法计算控制器参数的调节范围；将控制量输入到控制器，控制器根据控制器参数的调节范围计算逆变器的输入信号，改变SPWM驱动信号的占空比。本发明实现逆变器输出端LC滤波器参数的补偿，解决了逆变器输出电压包含谐波和偏差问题，达到提高单相光伏并网逆变器瞬态响应速度的效果。