本发明公开了一种基于阶次提取的电机电流谐波及转矩脉动抑制方法，包括以下步骤：一、根据转子旋转角度，等角度间隔地采集电机转角、转速、直交轴电流信号；二、构造角域单点傅里叶变换算法；三、使用步骤二中的角域单点傅里叶变换算法，对步骤一中采集的转速和电流信号进行阶次提取；四、通过PI控制器得到要注入的直交轴电压谐波；五、构造阶次单点傅里叶反变换算法；六、使用步骤五中的阶次单点傅里叶反变换算法，对步骤四中得到的直交轴电压谐波进行角域重构得到注入电压信号；七、叠加注入电压信号到电机控制策略的驱动电压指令值中进行谐波抑制。