本发明公开了一种利用微生物与铁矿制备掺杂碳催化材料的方法，包括以下步骤：(1)对微生物希瓦氏菌体进行扩大培养，离心得到湿菌体，加入铁矿进行培养，使希瓦氏菌将三价铁还原成二价铁，培养后进行离心、真空冷冻干燥，得到干菌体；(2)将步骤(1)得到的干菌体进行研磨，然后在惰性气体氛围下煅烧，酸洗活化后用蒸馏水洗至pH中性，干燥后过筛得到微生物掺杂碳材料粉末。本发明增加了材料的比表面积和导电性，促进了碳催化材料氧还原性能的提高。