本发明公开了一种具有双层结构的双频带通平衡滤波器，包括上层结构和下层结构，上层结构包括第一介质基板和第一微带线结构，下层结构包括第二介质基板和第二微带线结构，第一微带线结构设置在第一介质基板的顶面上，第二微带线结构设置在第二介质基板的底面上；第一微带线结构包括第一谐振器、第一阶跃阻抗枝节、第一端口馈电线和第二端口馈电线，第二微带线结构包括第二谐振器和第二阶跃阻抗枝节，第一阶跃阻抗枝节加载在第一谐振器的中心，第二阶跃阻抗枝节加载在第二谐振器的中心；上层结构与下层结构之间设有一金属片，金属片上开有缝隙，上层结构通过缝隙与下层结构耦合。本发明的滤波器带内性能良好、带外抑制能力强、共模抑制性能优秀。