本发明提供了一种多波长输出的超窄线宽单频光纤激光器，该单频光纤激光器包括高增益双包层二维阵列光纤、窄带光纤光栅阵列、二色镜或宽带光纤光栅阵列、泵浦光源（单模ＬＤ或多模ＬＤ或两者一起）、光纤隔离器、耦合透镜、波分复用器组成，它可以实现同时输出多路同波长或不同波长的单横模的高功率（＞１００ｍＷ）、超窄线宽（ＫＨｚ级）单频（单纵模）激光，并且同时输出的多路单频激光互不干扰。该发明可应用于对多个目标同时进行高精度的传感、探测和指示的军事或太空领域。