本发明公开了一种基于波形衰变特性的变压器差动保护定值调整方法，包括步骤：(1)变压器空载合闸，启动变压器差动保护；(2)变压器二次谐波含量与初始整定值进行比较：当二次谐波含量小于等于初始整定值时，判断为变压器内部故障，出口动作跳闸；当二次谐波含量大于初始整定值时，闭锁变压器差动保护，并进行涌流类型的判断；(3)根据涌流类型，对差动保护的整定门槛值进行调整。本发明使用基波幅值增量的方法来判断励磁涌流和和应涌流，利用三者之间的基波电流发展的趋势不同，来区别对待整定值，极大的提升了差动保护在励磁涌流及和应涌流期间对故障的灵敏性。