本发明公开了一种基于差动电流占空比的变压器差动保护方法、系统及介质，其中方法包括：设置差动电流占空比；根据差动电流占空比从差动电流波形的间断角出发构建第一条保护判据；根据差动电流占空比从差动电流波形的宽度出发构建第二条保护判据；根据差动电流占空比构建第三条保护判据；通过三个逻辑门对第一条保护判据、第二条保护判据、第三条保护判据和二次谐波制动判据进行配置，以构建最终的保护方案。本发明根据差动电流的占空比来构建三条反映差动电流波形特征的保护判据，将这三条判据与现有的二次谐波制动判据相结合来构成用于电力变压器的差动保护方案，以此来进一步提升变压器的安全性，可广泛应用于电力系统继电保护的技术领域。