本发明涉及有源滤波器APF的控制领域，为基于BP神经网络算法的最优虚拟谐波电阻控制方法，包括以下步骤：S1、设计基于最优虚拟谐波电阻的BP神经网络，最优虚拟谐波电阻使有源滤波器APF吸收的谐波功率最大；S2、将设计好的BP神经网络，加入有源滤波器APF，以控制有源滤波器APF运行在最优虚拟谐波电阻值处。本发明通过采集不同虚拟谐波电阻时PCC点的电压和电流，得到训练数据，基于BP神经网络算法，不断更新APF运行时的开关管PWM波形，当BP神经网络输出与上一次相比满足误差要求时，APF运行在最优虚拟谐波电阻值处，从而使得APF从电网最大程度地吸收谐波功率。