本发明公开了一种含复合储能微电网的多目标优化系统及方法，该含复合储能微电网的多目标优化系统由微电网中央控制器、储能控制器、光伏控制器和负荷控制器等控制器以及通信网络组成。含复合储能微电网的多目标优化方法针对包含光伏、液流电池和锂电池等储能装置的并网型复合储能微电网，以微电网购电费用和联络线功率波动两者最小为目标建立多目标优化模型。本发明基于二人零和博弈法确定加权系数，并采用线性加权方法将该模型转化为单目标优化问题进行求解。该含复合储能微电网的多目标优化系统可有效实现微电网可再生能源利用最大化、减少联络线功率波动和分布式电源并网运行冲击，提高微电网运行经济性。