本发明公开了一种基于粒子群优化算法的多台变流器协调控制方法，包括下述步骤：建立变流器的模型，分析并推导输出单元的传递函数；确定需要抑制的谐波频率大致范围，设定相应的PI控制器参数、确定粒子群优化算法的相关参数；随机初始化粒子i的虚拟电阻值R(i)与更新速度Vstep(i)；以变流器并网点电压的THD[R]为适应值函数来判断虚拟电阻粒子，初始化个体最优值和获取粒子群全局最优值；运用速度迭代公式及虚拟电阻迭代公式反复迭代至满足收敛条件或者到达最大迭代次数，从而确定虚拟电阻阻值；使各变流器的谐波虚拟电阻与谐波阻抗相等，从而实现多节点谐波电压的最佳抑制效果。本发明方法采用粒子群集优化算法能够对谐波虚拟电阻的大小进行快速、准确、全局的搜索。