本发明公开了一种二维色谱峰的检测方法，该方法首先获取样品经过第一色谱仪后所分离得到的各组分在进入到第二色谱仪后所得到的第二维色谱图，以从中获取到各组分的各色谱峰。针对于获取到的各组分的各色谱峰，每次选择一个参比色谱峰，其中在选择一个参比色谱峰后，首先通过该参比色谱峰的位置以及预设的扫描宽度扫描到其他组分的各色谱峰，以获取到初始色谱峰簇；然后初始色谱峰簇依次进行色谱峰保留时间判定规则、双向色谱峰峰宽重叠判定方式、色谱峰簇中仅保存各组分的一个色谱峰原则、单峰性判定方法更新处理后最终得到二维色谱峰簇。本发明方法具有维色谱峰检测速度快并且检测简以及准确的优点。