本发明公开了一种基于FFT与点频扫查的新能源汽车动态工况EMI测试方法，包括进行第一次EMI测试，基于FFT频谱分析采集全频段EMI，EMI测量值与EMI测试标准限值相减计算EMI特征值，计算特征频点，采集汽车速度，计算汽车加速度；根据速度、加速度辨识汽车工况，计算各工况特征频点分布图；根据各工况特征频点分布图，计算各工况最大特征值对应频率及特征频点密度最大区域对应频率范围；进行第二次EMI测试，对各工况最大特征值对应频率进行点频扫查，同时对各工况特征频点密度最大区域进行FFT频谱分析。本方法只需采集全频段EMI及汽车速度，即可实现高精度新能源汽车动态工况EMI测试，保证了新能源汽车EMI测试有效性及准确性。