本发明公开了一种基于协同近似计算的众核系统能耗与性能优化方法，该方法能够在控制应用程序输出结果满足一定误差范围的前提下，联合不同抽象层采用多种近似技术，包括在应用层级减少应用程序的计算工作量，在网络层有选择地删除数据以减少网络拥塞，通过全局控制器的优化调控与局部控制器的资源配置，将近似计算应用于众核系统的不同抽象层。该发明基于质量模型衡量丢弃的数据的重要性，考虑通信与计算的协同管理，制定一个多目标优化问题，以最小化网络拥塞、应用程序运行时间并限制结果质量，为众核系统提供加快应用程序运行时间、减少能源消耗、提高芯片级能源效率的新方法。