本发明公开的一种基于分布式内存计算的数据去重方法，包含以下顺序的步骤：创建文件分块指纹集并缓存到分布式内存中；按照最优的文件块划分策略对文件进行分块，并完成分块指纹计算，同内存中缓存的指纹集对比，找到匹配的分块，为其添加对应引用；分块指纹集的存储采用多级缓存策略，权值大的缓存到内存中，权值小的缓存到磁盘上；内存分为多个区域，存储不同类型的指纹信息，以对文件进行不同的指纹对比操作。本发明的数据去重方法，提高海量数据去重的效率，从而节省主机空间和网络带宽，为服务商降低数据运维的成本。