本发明提供图形化编程的自动编译方法，其主要包括以下步骤：图形化程序内存分配、图形化程序线程分配、图形化程序存储结构解析和图形化程序可执行文件生成。基于图形化编程的自动编译生成图形化程序对应可执行文件，用户根据功能要求自由组合图形化模块而形成程序，采用基于图形化编程的自动编译方法对图形化程序进行编译，生成可在控制器直接运行的文件。本发明不需要复杂的编译器和编译环境，就可以通过本发明自动生成图形化程序对应晦涩难懂的可执行文件，然后通过数据交换将生成的可执行文件传至控制器运行进而达到图形化程序相应的动作效果。