本发明公开了基于粒子群算法的全自动酶免疫仪工序调度方法，该方法通过输入接口处理模块、优化调度模块和输出处理模块实现，输入接口处理模块的功能是获取系统信息，计算每个工序的完成时间。基于粒子群算法的优化调度模块，先建立调度优化问题的目标模型，再基于粒子群算法对目标模型进行优化调度，从而得到总工期最短的工序序列。输出处理模块，对优化结果进行处理，将每个工序解析成若干个对子资源进行操作的指令，控制为控制设备运作提供数据和控制接口。