本发明公开了一种结合负载均衡的工作流回填方法，首先，依据计算任务特性，对任务进行划分，可分为CPU资源消耗型或者IO资源消耗型；然后对回填策略进行改进，使回填调度策略以工作流为单位；最后是回填任务的投递，即回填策略在任务选择上的改进，回填的任务选择需要匹配主机负载和任务特性，负载高主机选择IO消耗型，负载低则选择CPU消耗型。本发明方法能够有效地调度任务流，减少任务流的执行时间，同时还能够实现高性能计算系统众多节点的负载均衡。