本发明公开了一种脑部肿瘤头皮定位图像处理方法，包括以下步骤：（１）初步估计病人颅内肿瘤的头皮投影区域，在区域内贴上两个可被成像设备识别的标志点，从成像设备获取二维医学图像切片集，重建头皮表层的三维轮廓；（２）在二维图像上手动勾画出肿瘤轮廓线，重建肿瘤表面；（３）在二维图像上确定标志点位置，重建标志点；（４）将三维重建的轮廓图像旋转到合适位置，等比例打印输出。本发明相对于现有技术，实现简便；应用于脑部肿瘤定位时，精度满足开颅肿瘤手术要求，有利于缩短手术时间，减少手术创伤，能在保证良好暴露前提下尽量减小切口长度。