本发明公开了一种基于深度神经网络的黑色素瘤图片组织分割方法和系统，主要是利用深度神经网络技术来解决黑色素瘤的皮肤镜图片的组织分割问题，是一种用于医学图像的分析处理技术，主要是使用一种改进的深度神经网络结构建模，用已经有分割标签的皮肤镜图片训练该模型，然后训练好的模型对新的皮肤镜图片具有分割可疑组织的能力。本发明方法和系统旨在定位黑色素瘤皮肤镜图片中的可疑区域并对其进行像素级的分割；本发明使用了较新的深度学习技术，充分发挥其采集图像数据各种层次特征的能力，将其应用于建模过程中，能够较好的对可疑的皮肤组织进行定位、分割，能够为皮肤科医师的进一步分析提供很好的参考。