本发明公开了一种基于支付意愿的半灵活公交调度方法，包括步骤：1)选定拟提供半灵活公交服务模式的范围，获取传统公交数据及乘客的需求信息；2)根据数据对需求点进行处理，完成站点的初筛、分区及编号等过程；3)根据起讫点的站点类型建立相应的费用函数；4)重点考虑运输效益及乘客支付意愿，并兼顾时间、舒适度、满载率等因素，建立系统效益最优的半灵活公交调度模型；5)对调度模型进行求解，得到半灵活公交的调度方案。本发明能够使乘客根据自己的意愿预约并乘坐公交出行，在有效保证运输效益的基础上，更能充分体现半灵活公交在车辆设施、停靠站点、服务时间、舒适安全、自由私密等方面的高品质特性，具有实际推广价值。