本发明提供一种化肥废水处理工艺控制方法。该工艺先将化肥废水经过调节池匀质，再利用污水泵将调节池中废水泵入初级曝气池，以初步去除ＣＯＤ及为后续生化系统解除毒副作用，废水经初级沉淀池后，进入Ａ／Ｏ生物脱氮系统及后续物化深度处理系统，保持Ａ池（缺氧池）ＤＯ在０．５ｍｇ／Ｌ以下，由Ｏ池（好氧池）回流的硝化液为进水流量的３－５倍；维持Ｏ池的ｐＨ在６．５－８．５，ＤＯ维持在２－３ｍｇ／Ｌ，调节适当的污泥回流比，使生化系统可高效稳定运行。物化深度处理系统投加絮凝剂ＰＡＣ及ＰＡＭ，经反应沉淀后出水可达国家一级排放标准。