本发明公开了一种硅灰石活化生产中量元素矿物质肥的方法。其主要内容是将硅灰石、石膏、白泥、白云石等以及助添加剂Ａ和Ｂ等按一定比例混合，采用搅拌、烘干、成型、焙烧、冷却、球磨等工序，制备成含有钙、硅、镁、硫、氯等中量元素为主的复合肥料。肥料中的有效养分大于６０％，其中有效氧化钙大于２５％，有效二氧化硅大于２０％，有效氧化镁大于５％，有效三氧化硫大于５％，有效氯含量大于２％，并含有多种微量元素，肥料呈弱碱性。本发明的生产原料多由天然矿物质所组成，具有取材方便、成本低廉等优势，产品是一种用来调节酸性或盐碱地土壤理化性质、全面提升中微量元素水平的天然矿物质复合肥料，具有较高的应用价值和市场推广潜力。