本发明属于亚油酸乙酯制备技术领域，其公开了一种以离子液体微乳液催化合成亚油酸乙酯及其制备方法。其制备工艺：(1)往常规表面活性剂中加入非极性溶剂，混合均匀，再滴入咪唑类离子液体，充分混合，得到单离子液体微乳液；(2)把亚油酸和乙醇加入上述单离子液体微乳液中，加热反应，进行旋蒸后，得到亚油酸乙酯。本发明方法利用高温稳定性好的单离子液体微乳液作为反应介质，增加催化剂和反应底物的接触面积并把生成的水增溶在离子液体微乳内核中，加快反应速率；所用催化剂活性高，但对设备腐蚀小，设备要求低，解决了现有技术中存在的催化剂成本高、设备腐蚀严重、反应收率低、产品质量差、反应条件苛刻等问题，可推广应用于催化酯化反应中。