本发明属于复合材料技术领域，公开了一种基于碳纳米管有序排列的聚氯乙烯超滤膜及其制备方法与应用。所述制备方法为：首先采用碱性条件下ＦｅＣｌ３·６Ｈ２Ｏ、ＦｅＳＯ４·７Ｈ２Ｏ和碳纳米管进行反应得到具有磁性的碳纳米管，然后将其在溶剂中超声分散后与聚氯乙烯、成孔剂搅拌８～２０ｈ溶解共混均匀，形成铸膜液；将配制好的铸膜液脱泡后，置于支撑物上进行涂膜；然后将涂膜在磁场强度为２００～４００Ｏｅ的条件下作用５～１０ｍｉｎ，最后浸入去离子水中进行溶剂交换，得到基于碳纳米管有序排列的聚氯乙烯超滤膜。所得超滤膜具有分离能力好的优点，可用于蛋白质分离、工业废水处理、中水回用等领域。