本发明公开了一种褐藻多糖脱色脱蛋白的方法，属于褐藻深加工领域。该方法即紫外（UV）结合过氧化氢（H2O2）法。具体包括以下步骤：烘干粉碎后的褐藻经热水法提取后得到褐藻多糖，然后取褐藻多糖溶于含有H2O2水溶液中，并置于紫外光下进行辐照处理，以褐藻多糖质量浓度为2.5~10.0mg/mL，H2O2浓度为25~150mmol/L，紫外辐照时间为1.0~2.0h，去除褐藻多糖中的蛋白并脱色。本发明中不使用酸、碱和有机溶剂，绿色无污染，操作简单、安全、经济、省时。