本发明公开了一种利用菊苣/芋粕联产凝胶型和乳化型果胶的方法，包括原料预处理、浸提、过滤、浓缩、醇析、干燥等步骤。根据菊/芋苣粕的细胞壁结构与组织特性，本发明针对性地采用盐法、稀酸法进行提取，依次生产凝胶型、乳化型两种果胶产品；其中，凝胶型菊苣/芋果胶具有分子结构单一、纯度高、乙酰化度低、凝胶强度大的特点，乳化型菊苣/芋果胶则具有良好的乳化性能。本发明的菊苣/芋果胶提取方法可同时提供两种类型的果胶，拓宽菊苣/芋果胶的应用范围，并提高菊苣/芋粕的加工利用率。