本发明公开了含季鏻盐结构的聚（甲基）丙烯酸酯抗菌剂及其制备方法和在塑料中的应用。本发明制备的含季鏻盐结构的聚（甲基）丙烯酸酯抗菌剂，可以作为塑料的抗菌添加剂，用于制备抗菌塑料。该高分子抗菌剂的特征是含有热稳定性好、起始分解温度高的季鏻盐结构，作为抗菌添加剂，既能够适用于通用塑料的加工过程，赋予通用塑料优异抗菌性，也能够适用于加工温度较高的工程塑料的加工过程，赋予工程塑料优异抗菌性。