本发明属于材料领域，公开了一种分子印迹光子晶体及其制备方法和应用。结构式如式(1)所示的分子印迹光子晶体或其衍生物：式(1)中的a、b、m和n为正整数。该分子印迹光子晶体是一种交联聚合物，能够在5分钟内快速检测待测溶液中的镰刀菌酸，其检测下限可达10?7g/mL，并且能够用肉眼进行定性鉴定，无需其他专门仪器，操作简单，检测成本低。以实验室培养的香蕉枯萎病菌培养液、镰刀菌酸溶液和其他与镰刀菌酸具有类似结构化合物为样品进行检测，检测结果表明，本发明所提供的分子印迹光子晶体对镰刀菌酸具有专一性。