本发明公开了一种辣椒素改性丙烯酸乳液的制备方法，包括以下步骤：（１）称量物料（２）种子乳液聚合：在反应起始阶段，在反应器中加入乳化剂、第一引发剂、缓冲剂和去离子水，制得种子乳液；（３）核层聚合物的合成：向步骤（１）制得的种子乳液中平行滴加核单体和第二引发剂，制得核层聚合物；（４）壳层聚合物的合成：在步骤（２）所得的乳液中平行滴加壳单体和第三引发剂溶液，制得辣椒素改性丙烯酸乳液。本发明还公开了上述辣椒素改性丙烯酸乳液的制备方法制备得到的辣椒素改性丙烯酸乳液及其应用。本发明制备得到的辣椒素改性丙烯酸乳液能有效抑制海洋生物的附着与繁殖，制备方法简单，可操作性强。