本发明公开了硅改性缔合型水性聚氨酯增稠剂及其制备方法与应用，其制备方法是：在氮气保护下控制干燥后的聚乙二醇温度为60?70℃，加入反应活性基团封端的聚二甲基硅氧烷，再加入长链脂肪醇和二异氰酸酯，70℃?100℃反应2?5h，接着加入催化剂，升温至100℃?120℃反应1?2h，降温至50?60℃，添加助溶剂和水，充分搅拌，得到硅改性缔合型水性聚氨酯增稠剂。本发明得到的产品亮点在于，增稠效率高，并且在乙醇体系中，本产品能够表现出优异的抗干扰性能。