本发明公开了一种防霉变聚氨酯预聚体的制备方法；该制备方法包括如下步骤：１）将聚醚多元醇加入反应釜中，抽真空，控温并用搅拌器搅拌；２）氮气保护下，使体系降温，加入二异氰酸酯和适量催化剂，控温同时加大搅拌速度；４）根据体系中ＮＣＯ含量，向反应体系缓慢加入硅烷偶联剂，继续搅拌；５）体系加入一定量羟基（或氨基）噻吩齐聚物，继续搅拌；６）反应结束，体系抽真空除去气泡，即可得到目标产物。本发明所得的聚氨酯预聚体具有优异的防霉变性能，且力学性能不受影响。