本发明公开了一种含季铵盐基团的聚硅氧烷嵌段共聚物及制备方法与应用。本发明通过对ＢＡＰＴＭＤＳ中的伯氨基进行保护，将得到的ＢＡＰＴＭＤＳ?ＰＡ２与Ｄ４、Ｄ４Ｈ反应，得到含氢聚硅氧烷；将其与ＤＭＡＡ反应，得到叔胺基聚硅氧烷；将其与一水合肼反应，得到带有端氨基的叔胺基聚硅氧烷；将Ｄ３和正丁基锂溶液反应，得到单端含氢聚硅氧烷；将其与ｔＢＭＡ反应，得到单端酯基聚硅氧烷；将其与硫酸反应，得到单端羧基聚硅氧烷；将其与前述的带有端氨基的叔胺基聚硅氧烷反应，接着再于卤代烃反应，得到含季铵盐基团的聚硅氧烷嵌段共聚物。该共聚物能有效的粘附在植物叶片等疏水性的表面，起到防止植物真菌病害的作用。