本发明属于热固性树脂基复合材料领域，公开了一种非连续纤维增强聚六氢三嗪树脂基导热复合材料及其制备方法，该方法为将甲醛和芳香胺均匀溶于水/非质子溶剂混合溶液中，所得反应液进行预聚，获得预聚物溶液，将导热填料和非连续纤维均匀混合于预聚物溶液中，加入溶剂进行沉淀，过滤、干燥后获得预浸料；或将甲醛和芳香胺在非质子/水混合溶剂中预聚，再加溶剂沉淀，干燥后获得粉状预聚物，将其与导热填料和非连续纤维混合均匀，获得预浸料；将预浸料热压固化成型，即得到复合材料；所述芳香胺为至少含有一种具有芳香酰胺或芳香酯结构的芳香二胺。该复合材料具有优良的机械和导热性能，且制备工艺简单，制得的复合材料可以回收再利用。