本发明涉及一种圆褐固氮菌生物絮凝剂及其制备方法。微生物絮凝剂制备因培养成本高、周期长、发酵后需固液分离，使产品成本增加。本发明用甘露醇、KH2PO4、MgSO4·7H2O、NaCl、CaCO3、CaSO4·2H2O加水配置发酵培养基；取已活化的圆褐固氮菌的固体斜面菌种，接种至发酵培养基培养得到发酵种子液，按10%的体积比接种至发酵培养基中培养；结束后加入无水乙醇静置沉淀，收集沉淀烘干，得到生物絮凝剂。本发明采用圆褐固氮菌作为絮凝材料，絮凝成分主要为胞外多聚物多糖、粘性荚膜多糖及发酵过程产生的有机酸、氨基酸等，絮凝效果明显，安全性高于传统絮凝剂；发酵液及菌体均为絮凝剂成分，不需要固液分离，减少分离成本；培养周期短，热稳定性好。